Capítulos de la segunda temporada

  • Bolshoi booze

Michael contrata un guía para conseguir un avión, mientras Lincoln deja a LJ. T-Bag se escapa y mata a Geary. Kellerman tortura a Sara. Mahone trata de ubicar Bolshoi Booze.

  • Desconectado

Mahone busca el avión de Michael, mientras este último se reúne con su padre. Sara escapa de Kellerman, quien es castigado por el agente Kim. C-Note se arriesga a ser capturado. Bellick es acusado del asesinato de Geary.

  • Rodeados

T-Bag busca a Susan. Bellick es encontrado culpable y es encarcelado en Fox River, mientras que Michael y Lincoln son atrapados por la policía de la frontera. Sucre salta desde el avión para evitar ser atrapado. Kellerman idea un nuevo plan.

  • John Doe

Michael, Lincoln y Kellerman encuentran a Steadman. Bellick es maltratado en la cárcel. C-Note continua solo con su hija y T-Bag se encuentra con Susan y su familia.

  • El mensaje

Michael, Lincoln y Kellerman secuestran a un camarógrafo para enviar un mensaje a Sara y a la opinión pública. Bellick es trasladado a la enfermería. Haywire conoce a dos jóvenes, mientras Sucre roba un auto en México.

  • Chicago

Michael y Sara tienen su primer momento intimo mientras viajan en tren con Lincoln y Kellerman. Mahone asigna a Bellick como agente del FBI, mientras el primero busca a Haywire, quien luego se suicida. C-Note se arriesga a ser atrapado, y T-Bag mantiene a los Hollanders como rehenes.