Capítulos de la cuarta temporada

  • El estado del sol

Después de que el General obligara a Lincoln a trabajar con T-Bag, Gretchen y Self, el nuevo equipo viaja a Miami en busca del supuesto comprador que se llevó Scylla. Entretanto, Sara espera noticias de Michael en un hotel mientras éste se despierta en una casa en mitad de un bosque. El dueño es un psiquiatra que trabaja para La Compañía y que le asegura que su madre sigue viva y también trabaja para ellos.

  • Carga materna

Michael y Sara emprenden el viaje hacia Miami, donde el resto del equipo trata de interceptar Scylla. Sin embargo, el plan de Michael será diferente, ya que desaprueba el pacto de Lincoln con La Compañía. Gretchen sufre las consecuencias de querer traicionar al grupo mientras el General comienza a impacientarse con la ausencia de resultados.

  • VS.

Lincoln descubre que su madre está detrás del robo de Scylla y del plan para acabar con el General. Mientras, Michael consigue llegar a Miami con Sara, que sospecha que está embarazada. El General  desconfía de Christina, la madre de los hermanos Scofield y Burrows, y cree que podría estar detrás de su intento de asesinato.

  • Hijo de puta

T-Bag traiciona la confianza del equipo y le cuenta al General que la madre de Scofield está detrás del robo de Scylla. El jefe de La Compañía se traslada a Miami, donde le da un ultimátum a Lincoln. Mientras, Scofield llama a su hermano para advertirle de que el científico que tienen retenido trabaja para su madre.

  • Indios y vaqueros

Michael y Sara capturan a Christina y tratan de obtener información sobre el paradero de Scylla. Ésta les lleva hasta una conferencia sobre energía a la que también acudirá Lincoln. Sin embargo, solo se trata de otra trampa en la que el mayor de los hermano saldrá muy perjudicado. Michael deberá tomar la decisión más difícil de su vida.